植物肽与动物肽的差异并不多。
在氨基酸组成和数量上的差异：动物蛋白中，一般都含有人体的8种氨1基酸，与人类的营养结构比较吻合；植物蛋白在缺乏免疫球蛋白，谷物缺乏赖氨酸等。
在被人体吸收方面：动物蛋白更易被吸收。
优缺点方面：动物蛋白虽然容易被吸收，但其往往混有一定脂肪。
动物蛋白-主要来源于禽、畜、鱼类和昆虫等的。
靶向效应好。研究表明，动物的不同器官所含的小分子活性肽的种类、数量是不同的，心脏所含有的活性肽主要对心脏产生作用，而肝脏所含的活性肽主要对肝脏产生作用。同时，动物的不同器官有选择性聚集了不同的微量元素，如心脏多含钴、锌，肝脏多含铁，骨髓多含钙、镁等。
动物肽在功能方面比较单一，而植物肽确是比较多功能的。
动物肽活性高，比如牛骨肽为佳。这些蛋白质基料与人体蛋白质接近，属好的蛋白质。这种蛋白质用植物蛋白酶催化出来的肽与人体合成肽极为相似，易被人体吸收，易发挥生理功能。
动物蛋白酶分解动物蛋白质生产出来的肽为佳。这种方法生产出来的多肽，不仅消除了动植物蛋白的过敏原，而且无任何化学残基，没有苦味、异味，其风味独特，气味芳香。
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